一、侵犯商业秘密赔偿数额的认定
法院在确定侵犯商业秘密的实际损失时，应充分考虑各方面的因素，并采取以下4种方式计算赔偿数额：
1、以商业秘密权利人因侵权行为遭受的损失为赔偿额。这种赔偿的计算方式要求侵害人对于商业秘密权利人可计算的财产、收入方面的损失，应全部予以赔偿。
2、以侵权人因侵权行为获得的利润为赔偿额。侵权人因侵权所获得的利益可以根据该侵权产品在市场上销售的总数乘以每件侵权产品的合理利润所得之积计算。侵权人因侵权所获得的利益一般按照侵权人的营业利润计算，对于完全以侵权为业的侵权人，可以按照销售利润计算。具体来说，对于违法将商业秘密出卖给他人的，以其违法、出卖的收入为赔偿额;对于违法使用商业秘密进行生产经营活动的，以其获得或增加的利润为赔偿额。商业秘密权利人的损失往往难以计算，法院通常以侵权人所获得的利润作为裁判的依据。在计算侵权人侵权期间因侵权所获得的利润时，不能简单地以销售额为获利额，也不能以已生产的产品的价格总额乘以平均利润率为获利额，应当以“销售额×平均利润率=获利额”较为妥当。当这个平均利润率无法查明时，可委托评估机构进行评估。此外，商业秘密权利人的损失包括已经遭受的损失和必然遭受的损失即直接损失和间接损失，侵权人的获利是实际获利，而不包括预期获利。
3、以不低于商业秘密许可使用的合理费用为赔偿额。当商业秘密权利人与他人曾签有商业秘密许可使用合同时，可采用此种方式计算赔偿额。这是假定侵权人在正常情况下取得权利人商业秘密的许可使用时，其许可使用费应该是多少，再推定该数额为赔偿数额。当然，使用该方法计算赔偿数额，应综合考虑侵权人的性质、情节以及商业秘密许可的性质、范围、时间等因素，在不低于许可使用费至该许可使用费的3倍幅度内确定;同时还应防止商业秘密权利人与他人相互串通虚构许可使用合同及许可使用费，以向侵权人收取巨额赔偿。
4、定额赔偿。定额赔偿就是由人民法院根据案件的具体情况酌情确定赔偿额。在知识产权侵权损害赔偿中，经常出现原告的损失和被告的获利均无法查明的情况，司法实践中采取酌情赔偿的方法来处理。修改后的著作权法、商标法和专利案件的司法解释都规定了酌情赔偿的数额最高不超过50万元。
由于侵犯商业秘密行为的损害赔偿额，可以参照确定侵犯专利权的损害赔偿额的方法进行,因此，对于侵犯商业秘密的损害赔偿也应是一般在5000元以上30万元以下确定赔偿数额，最多不得超过人民币50万元。除此之外，当事人自愿协商赔偿额也是实践中常用的一种方式，只要这种取舍不损害国家、社会或者第三人的合法权益。
二、怎么认定商业秘密
1、秘密性
也就是不为公众所知悉，指该信息无法从公开渠道直接获取，这是商业秘密区别于其他信息的显著标志。公开渠道一般是指包括公开的出版物、公开销售和使用、反向工程以及口头泄密等。
不为公众所知悉不仅意味着该信息不能从公开渠道直接获取，也包括不为权利人以外的其他人以违反诚实经营活动的方式所知悉，如违反合同约定，违反保密纪律等;同时，知晓该商业秘密知晓的范围也仅限于非常有限的特定人员，如企业内部有关职工以及企业外部原料供应商等。
2、具有价值
作为商业秘密的技术信息或者经营信息能够给权利人带来实际的或潜在的经济利益及竞争优势，这即是商业秘密的价值所在，也是获得法律保护的根本原因，否则，该信息即使符合商业秘密的其他要件，法律也没有对之进行保护的必要。
3、实用性
主要是指该项技术能够投入生产使用、能够解决生产、经营中的现实问题。抽象的概念和原理、原则如果不能转化为具体的可以操作的方案，是不能获得法律保护的。
4、保密性
这要求权利人在主观上具有保密意愿，并且就相关信息采取了适当的保密措施。保密措施既包括各种“硬件”措施，如将有关文件放置在保险柜中、架设电子眼监控等，还包括各样的“软件”措施，例如建立保密制度、与员工签订保密协议等。
法律对保密措施并没有提出明确的要求，只要达到合理的程度即可。至于权利人采取的保密措施是否达到了适当的程度，应根据不同案件的各种因素确定。
三、商业秘密罪的立案标准
根据我国刑法第二百一十九条规定，侵犯商业秘密罪的客观要件是指侵犯他人商业秘密，造成商业秘密权利人重大损失的行为。
因此，侵犯商业秘密罪客观要件包括三个方面，即犯罪对象是商业秘密;犯罪行为表现对商业秘密的侵犯性;危害的后果是造成商业秘密权利人重大损失。
侵犯商业秘密罪无疑是结果犯罪，给商业秘密权利人造成重大损失是区分刑事犯罪还是民事侵权的分水岭。何为重大损失，立法并没有作出解释。
2010年5月7日，最高人民检察院、公安部发布的《关于经济犯罪案件追诉标准的规定》中规定侵犯商业秘密，涉嫌下列情形的应予以追诉：
1、给商业秘密的权利人造成损失数额在50万元以上的;
2、因侵犯商业秘密违法所得数额在50万元以上的;
3、致使商业秘密权利人破产的;
4、其他给商业秘密权利人造成重大损失的情形。
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